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基于全基因組水平的維吾爾族多囊卵巢綜合征患者卵巢組織的特異性甲基化譜改變

作者:朱金虎; 楊琇瑋; 萬(wàn)迎香; 洪小山; 毛婷 廣東省婦幼保健院婦科; 廣州511400; 喀什地區(qū)第一人民醫(yī)院婦科; 新疆維吾爾自治區(qū)844000

摘要:目的在全基因組水平上,探討維吾爾族多囊卵巢綜合征(PCOS)患者卵巢組織的特異性甲基化譜改變。方法選擇2014年5月至2016年6月,于喀什地區(qū)第一人民醫(yī)院進(jìn)行診治的60例維吾爾族PCOS患者的卵巢組織(PCOS組)及60例維吾爾族卵巢囊腫患者的正常卵巢組織(對(duì)照組)為研究對(duì)象。采用甲基化DNA免疫共沉淀結(jié)合芯片(MeDIP-chip)技術(shù),對(duì)2組卵巢組織的基因組DNA進(jìn)行全基因組胞嘧啶-磷酸-鳥嘌呤(CpG)島和啟動(dòng)子區(qū)域甲基化掃描。將MeDIP-chip結(jié)果中,峰值得分≥2的區(qū)域,判定為陽(yáng)性甲基化區(qū)域,以篩選甲基化基因;對(duì)PCOS卵巢組織峰值得分≥5的特異性高甲基化基因,進(jìn)行基因本體(GO)分析及Pathway分析,以探討這些特異性高甲基化基因?qū)C(jī)體相關(guān)功能的影響。對(duì)2組卵巢組織的甲基化譜差異,采用配對(duì)t檢驗(yàn)及χ2檢驗(yàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)比較。本研究遵循的程序符合2013年修訂的《世界醫(yī)學(xué)協(xié)會(huì)赫爾辛基宣言》的要求,所有受試者均自愿參加本研究,并簽署知情同意書。結(jié)果①M(fèi)eDIP-chip結(jié)果顯示:PCOS組全基因組CpG島和啟動(dòng)子的甲基化率,分別為12.9%(3633/28226)和3.8%(687/18028),對(duì)照組分別為13.3%(3759/28226)和3.6%(643/18028)。2組卵巢組織全基因組整體甲基化水平,以及甲基化片段在基因組各區(qū)的分布比較,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。②2組卵巢組織全基因組轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)的上游調(diào)控區(qū)和核心啟動(dòng)子區(qū)域甲基化水平比較,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。PCOS組轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)的基因編碼區(qū)甲基化水平為(3.14±0.21),顯著低于對(duì)照組的(3.96±0.23),并且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=2.653,P=0.010)。③2組卵巢組織全基因組高甲基化啟動(dòng)子的高-CpG含量啟動(dòng)子(HCP)、中-CpG含量啟動(dòng)子(ICP)及低-CpG含量啟動(dòng)子(LCP)的分布比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=3.208,P=0.002),其中PCOS組卵巢組織全基因組HCP比例最高(40.1%),對(duì)照組HCP比例則最低(13.3%)。PCOS組卵巢組織全?

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