摘要:目的在全基因組水平上,探討維吾爾族多囊卵巢綜合征(PCOS)患者卵巢組織的特異性甲基化譜改變。方法選擇2014年5月至2016年6月,于喀什地區(qū)第一人民醫(yī)院進(jìn)行診治的60例維吾爾族PCOS患者的卵巢組織(PCOS組)及60例維吾爾族卵巢囊腫患者的正常卵巢組織(對(duì)照組)為研究對(duì)象。采用甲基化DNA免疫共沉淀結(jié)合芯片(MeDIP-chip)技術(shù),對(duì)2組卵巢組織的基因組DNA進(jìn)行全基因組胞嘧啶-磷酸-鳥嘌呤(CpG)島和啟動(dòng)子區(qū)域甲基化掃描。將MeDIP-chip結(jié)果中,峰值得分≥2的區(qū)域,判定為陽(yáng)性甲基化區(qū)域,以篩選甲基化基因;對(duì)PCOS卵巢組織峰值得分≥5的特異性高甲基化基因,進(jìn)行基因本體(GO)分析及Pathway分析,以探討這些特異性高甲基化基因?qū)C(jī)體相關(guān)功能的影響。對(duì)2組卵巢組織的甲基化譜差異,采用配對(duì)t檢驗(yàn)及χ2檢驗(yàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)比較。本研究遵循的程序符合2013年修訂的《世界醫(yī)學(xué)協(xié)會(huì)赫爾辛基宣言》的要求,所有受試者均自愿參加本研究,并簽署知情同意書。結(jié)果①M(fèi)eDIP-chip結(jié)果顯示:PCOS組全基因組CpG島和啟動(dòng)子的甲基化率,分別為12.9%(3633/28226)和3.8%(687/18028),對(duì)照組分別為13.3%(3759/28226)和3.6%(643/18028)。2組卵巢組織全基因組整體甲基化水平,以及甲基化片段在基因組各區(qū)的分布比較,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。②2組卵巢組織全基因組轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)的上游調(diào)控區(qū)和核心啟動(dòng)子區(qū)域甲基化水平比較,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。PCOS組轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)的基因編碼區(qū)甲基化水平為(3.14±0.21),顯著低于對(duì)照組的(3.96±0.23),并且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=2.653,P=0.010)。③2組卵巢組織全基因組高甲基化啟動(dòng)子的高-CpG含量啟動(dòng)子(HCP)、中-CpG含量啟動(dòng)子(ICP)及低-CpG含量啟動(dòng)子(LCP)的分布比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=3.208,P=0.002),其中PCOS組卵巢組織全基因組HCP比例最高(40.1%),對(duì)照組HCP比例則最低(13.3%)。PCOS組卵巢組織全?
注:因版權(quán)方要求,不能公開(kāi)全文,如需全文,請(qǐng)咨詢雜志社
國(guó)際刊號(hào):2096-7586
國(guó)內(nèi)刊號(hào):42-1907/C