摘要：目的觀察云南玉龍鼠疫菌株D106004和青藏高原鼠疫菌株Z176003在基因組上的差異及遺傳學(xué)特征。方法應(yīng)用BLAST軟件,將鼠疫D106004和Z176003菌株編碼序列(CDS)進行差異比對。選取22個差異CDS,設(shè)計相應(yīng)引物22對,在來源不同(青藏高原喜馬拉雅旱獺鼠疫自然疫源地和云南齊氏姬鼠、大絨鼠鼠疫自然疫源地)、時間跨度約50年、分布地區(qū)包括西藏、青海、四川、甘肅、云南的6種生態(tài)型119株鼠疫代表性菌株進行PCR擴增,并將PCR產(chǎn)物測序驗證。菌株均來自中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所傳染病預(yù)防控制國家重點實驗室。結(jié)果119株鼠疫代表性菌株的22個差異CDS,PCR擴增產(chǎn)物實際測序結(jié)果累計序列長度為2.13 × 10^6 bp;差異CDS在云南玉龍D106004與青藏高原Z176003菌株所屬疫源地內(nèi)119株鼠疫代表性菌株中同源性較高,78.2%(2 047/2 618)序列不存在差異,21.8%(571/2 618)序列上存在缺失、錯義、移碼3類基因突變差異。差異特征在疫源地6種生態(tài)型鼠疫菌株中穩(wěn)定存在,呈現(xiàn)6種不同的地理分布。結(jié)論云南玉龍D106004和青藏高原Z176003菌株,二者同源性較高,親緣關(guān)系相近,基因組上存在的差異較小,但不同生態(tài)型菌株的遺傳性特征穩(wěn)定存在.