摘要：目的應(yīng)用生物信息學(xué)方法對結(jié)核分枝桿菌Rv1818c基因編碼蛋白PE_PGRS33的結(jié)構(gòu)和功能進行預(yù)測分析。 方法自GenBank數(shù)據(jù)庫中提取Rv1818c基因相關(guān)基因信息;運用ProtParam及ProtScale預(yù)測其編碼的PE_PGRS33蛋白理化性質(zhì)和親疏水性;分別運用NetPhos、TMHMM分析PE_PGRS33的磷酸化位點、跨膜螺旋;利用SOPMA、SWISS、MODEL分析PE_PGRS33蛋白的二級結(jié)構(gòu)并建立三級結(jié)構(gòu)模型;利用Bepired、ABCpred及SYFPEITHI預(yù)測PE_PGRS33蛋白的B細(xì)胞與T細(xì)胞表位。 結(jié)果Rv1818c基因編碼的PE_PGRS33蛋白含有498個氨基酸殘基,疏水系數(shù)0.425,為疏水性蛋白。PE_PGRS33含有7個磷酸化位點,不存在跨膜區(qū)域,二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)卷曲為主(占50.20%),結(jié)構(gòu)較松散。利用SWISS-MODEL建構(gòu)建出PE_PGRS33蛋白的三級結(jié)構(gòu)。PE_PGRS33蛋白含有27個B細(xì)胞抗原表位,數(shù)個T細(xì)胞優(yōu)勢表位。 結(jié)論PE_PGRS33蛋白是結(jié)核分枝桿菌的重要表面暴露蛋白,與結(jié)核分枝桿菌的潛伏感染密切相關(guān)。生物信息學(xué)預(yù)測該蛋白含有多個抗原表位,可作為結(jié)核治療的潛在分子靶標(biāo)。