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寧夏地區(qū)一株奶牛源耐甲氧西林金黃色葡萄球菌流行株的高通量測(cè)序分析

作者:陳程; 王曈; 常佳偉; 萬(wàn)佳宏; 王桂琴 寧夏大學(xué)農(nóng)學(xué)院; 寧夏銀川750021

摘要:【背景】耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, MRSA)是一種常見(jiàn)的條件性致病菌,由MRSA感染導(dǎo)致的奶牛乳腺炎給奶牛養(yǎng)殖戶帶來(lái)了重大的經(jīng)濟(jì)損失?!灸康摹苛私鈱幭牡貐^(qū)奶牛源MRSA流行株基因組序列特征,為MRSA感染的防治提供理論依據(jù)?!痉椒ā坎捎铆傊瑪U(kuò)散法對(duì)分離株ld11進(jìn)行抗菌藥物敏感性試驗(yàn),同時(shí)運(yùn)用Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)其基因組DNA進(jìn)行高通量測(cè)序,使用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)獲得的測(cè)序序列進(jìn)行處理分析。【結(jié)果】藥敏試驗(yàn)結(jié)果顯示分離株ld11對(duì)頭孢噻呋、磺胺異惡唑、氨芐西林、紅霉素、慶大霉素、苯唑西林、克林霉素、四環(huán)素和多西環(huán)素耐藥,數(shù)據(jù)分析顯示分離株ld11攜帶耐藥基因aadD、spc、str、blaZ、mecA、cat(pC194)、erm(A)、norA、tet(k)和tet(M),二者之間有很好的相關(guān)性;分離株ld11攜帶的耐藥基因多于MRSA參考菌株,且分離株ld11和MRSA252的親緣關(guān)系較近。COG功能分析和GO注釋結(jié)果顯示,與維持菌體基本功能和菌株生長(zhǎng)增殖相關(guān)的基因占優(yōu)勢(shì);KEGG通路分析結(jié)果顯示,屬于代謝通路的基因占比最多。從該菌株基因組序列上共檢測(cè)到4個(gè)基因島、9個(gè)疑似的CRISPR序列和1個(gè)完整的前噬菌體序列?!窘Y(jié)論】揭示了寧夏地區(qū)奶牛源MRSA流行株的部分基因組序列信息,為MRSA菌株間基因組序列信息的比較分析及MRSA感染的防控提供參考依據(jù)。

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