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基于糞便DNA及宏條形碼技術(shù)的食肉動(dòng)物快速調(diào)查及食性分析

作者:邵昕寧; 宋大昭; 黃巧雯; 李晟; 姚蒙 北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 北京100871; 北京大學(xué)生態(tài)研究中心; 北京100871; 中國貓科動(dòng)物保護(hù)聯(lián)盟; 北京101011

摘要:在陸地生態(tài)系統(tǒng)中,大型食肉動(dòng)物對(duì)于穩(wěn)定食物網(wǎng)結(jié)構(gòu)和生態(tài)系統(tǒng)功能有重要作用。在世界范圍內(nèi),由于棲息地喪失和破碎化、獵殺、人類活動(dòng)干擾以及病原體的傳播,大型食肉動(dòng)物生存正面臨嚴(yán)重威脅,多種食肉動(dòng)物地理分布范圍及種群數(shù)量大幅度縮減。如何有效保護(hù)大型食肉動(dòng)物物種多樣性及種群已經(jīng)成為世界關(guān)注的焦點(diǎn)問題和保護(hù)生物學(xué)的重要研究方向。川西高原地處我國西南山地與青藏高原東緣交界地帶,屬于世界生物多樣性熱點(diǎn)地區(qū),是世界大型食肉動(dòng)物物種最豐富的地區(qū)之一,而日益增強(qiáng)的人類活動(dòng)可能會(huì)加劇對(duì)當(dāng)?shù)貏?dòng)植物資源的破壞,進(jìn)而威脅野生食肉動(dòng)物的生存。獲得準(zhǔn)確的物種多樣性信息及食肉動(dòng)物食性數(shù)據(jù)有助于深入了解該地區(qū)生態(tài)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)及食物網(wǎng)關(guān)系,對(duì)研究物種共存機(jī)制及生物多樣性保護(hù)有重要意義。本研究通過從四川甘孜藏族自治州新龍縣和石渠縣野外采集的食肉動(dòng)物糞便樣品中提取DNA,利用DNA條形碼進(jìn)行物種鑒定,快速獲得該地區(qū)食肉動(dòng)物物種構(gòu)成信息。38份糞便樣品經(jīng)鑒定來自于7種食肉動(dòng)物,分別為5種大型食肉動(dòng)物(狼Canis lupus、棕熊Ursusarctos、豹Pantherapardus、雪豹P.unica、狗Canislupusfamiliaris)和2種中小型食肉動(dòng)物(豹貓Prionailurus bengalensis、赤狐Vulpes vulpes)。進(jìn)一步利用高通量測(cè)序和宏條形碼技術(shù)對(duì)7種食肉動(dòng)物糞便中的食物DNA進(jìn)行精準(zhǔn)食性分析,得到包含19種哺乳類、8種鳥類和1種魚類共計(jì)28個(gè)不同的食物分子可操作分類單元(molecular operational taxonomic unit, MOTU)。結(jié)果顯示,狼、狗、棕熊最主要的食物來源為偶蹄目動(dòng)物,其中取食頻率最高的物種為家牦牛(Bosgrunniens);而豹貓和赤狐食物中小型哺乳動(dòng)物如嚙齒目和兔形目占重要比例,其中高原松田鼠(Neodonirene)和高原鼠兔(Ochotonacurzoniae)被取食頻率最高。豹和雪豹的食物分別為偶?

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生物多樣性

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