摘要：藥物靶標(biāo)作用關(guān)系預(yù)測(cè)是一種重要的輔助藥物研發(fā)手段,而生物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證藥物靶標(biāo)作用關(guān)系耗錢(qián)耗時(shí),因此,在數(shù)據(jù)庫(kù)中查詢(xún)驗(yàn)證預(yù)測(cè)的藥物靶標(biāo)作用關(guān)系是對(duì)預(yù)測(cè)方法的重要評(píng)價(jià).基于KEGG,DrugBank,ChEMBL這3個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù),利用爬蟲(chóng)獲取信息的方式設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)了藥物靶標(biāo)作用關(guān)系查詢(xún)驗(yàn)證方法DTcheck(drug-target check),實(shí)現(xiàn)了對(duì)于提供KEGG DRUG ID及KEGG GENES ID的藥物靶標(biāo)對(duì)的高效查詢(xún)驗(yàn)證功能,并利用DTcheck分別為Enzyme,IC(ion channel),GPCR(G-protein-coupled receptor),NR(nuclear receptor)四個(gè)標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集擴(kuò)充新增藥物靶標(biāo)作用關(guān)系907,766,458,40對(duì).此外,結(jié)合DTcheck查詢(xún)驗(yàn)證,以BLM(bipartite local models)方法為例分析了預(yù)測(cè)結(jié)果的評(píng)價(jià)問(wèn)題,結(jié)果表明,采用AUC(area under curve)值評(píng)價(jià)藥物靶標(biāo)作用關(guān)系預(yù)測(cè)方法沒(méi)有Top N 評(píng)價(jià)合理,且AUC值低的BLMd方法在預(yù)測(cè)新的藥物靶標(biāo)作用關(guān)系時(shí)優(yōu)于AUC值高的BLMmax方法.