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西藏絨山羊KAP6.2基因SNPs位點(diǎn)的檢測及分析

作者:周群; 旦巴; 富國文; 王紹卿; 吳玉江; 索朗達(dá); 巴貴; 次仁德吉; 德吉; 樊月圓 云南農(nóng)業(yè)大學(xué); 云南昆明650000; 西藏阿里地區(qū)動物疫病預(yù)防控制中心; 西藏阿里地區(qū)859000; 西藏自治區(qū)農(nóng)牧科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所; 西藏拉薩850009

摘要:旨在研究絨毛品質(zhì)相關(guān)基因KAP6.2在西藏絨山羊群體中的多態(tài)性,分析KAP6.2在不同山羊中的差異。采用聚合酶鏈反應(yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性和DNA測序等技術(shù)對隨機(jī)選取的127只西藏絨山羊的 KAP6.2 基因進(jìn)行突變位點(diǎn)檢測及多態(tài)性指標(biāo)分析。結(jié)果表明,西藏絨山羊 KAP6.2 基因存在兩種基因型 AA和AB,其中等位基因A 為優(yōu)勢等位基因,多態(tài)信息含量為0.196 (屬低度多態(tài))。經(jīng)測序并與GenBank中山羊KAP 6.2(No.AY316158)基因序列比對后共發(fā)現(xiàn)4處變異,分別為:178nt處24個(gè)堿基的缺失導(dǎo)致Ser48>Gly55氨基酸的丟失;113 nt處GT>CC突變導(dǎo)致氨基酸P.19Ser>Trp;121 nt處A>G突變?yōu)橥x突變;168nt處C>T突變導(dǎo)致氨基酸P.41Thr>Tyr。這些氨基酸的突變很可能導(dǎo)致結(jié)構(gòu)蛋白功能的改變,進(jìn)而對西藏絨山羊的絨毛品質(zhì)產(chǎn)生影響。通過研究影響西藏絨山羊絨毛品質(zhì)的 KAP6.2 基因的多態(tài)性,深入了解其分子遺傳基礎(chǔ),有利于利用分子遺傳標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行西藏絨山羊的選育。

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