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短短芽孢桿菌GZDF3嗜鐵素合成酶基因 Gene5693 的生物信息學分析及原核表達

作者:袁林; 賈化可; 盛淼淼; 王兵; 曾麗娜; 劉紅美; 隆耀航 貴州醫(yī)科大學醫(yī)藥生物技術研究中心; 貴州貴陽550025; 貴州醫(yī)科大學生物與醫(yī)學工程重點實驗室; 貴州貴陽550025; 貴州省教育廳免疫細胞與抗體工程研究中心; 貴州貴陽550025; 貴州醫(yī)科大學生物與工程學院; 貴州貴陽550025

摘要:目的:從短短芽孢桿菌GZDF3菌株中克隆嗜鐵素合成酶基因Gene5693,構建其原核表達載體并進行重組表達。方法:利用antiSMASH軟件對GZDF3全基因組序列進行次級代謝物預測分析,然后采用ExPASy在線分析預測嗜鐵素合成酶基因Gene5693的基本理化性質并進行重組表達。結果:生物信息學分析結果顯示,短短芽孢桿菌GZDF3全基因組序列與Petrobactin嗜鐵素基因簇的相似性為83%,Gene5693基因編碼的蛋白與Petrobactin嗜鐵素編碼的蛋白AsbE的相似性為51.06%;Gene5693編碼蛋白氨基酸長度為327個氨基酸,分子量為39.05kDa,等電點(pI)為4.94,為酸性親水性蛋白;Gene5693基因的PCR擴增成功獲得預測的Gene5693基因片段,菌落PCR及重組DNA分子的雙酶切電泳結果顯示成功構建重組質粒;SDS-PAGE結果表明Gene5693編碼的蛋白大小與生物信息學預測的結果一致。結論:成功克隆了嗜鐵素合成基因Gene5693,并進行了重組表達。

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貴州醫(yī)科大學學報

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